После обновления Ubuntu до версии 12.04 я обнаружил такой интересный баг: в списке контактов и в окнах сообщений русские буквы отображаются некорректно:

Как это исправить? Очень просто:

1. устанавливаем пакет qt4-qtconfig
2. запускаем утилиту настройки qtconfig-qt4
3. выбираем в качестве шрифта по-умолчанию какой-нибудь приятный вам шрифт (например Ubuntu, начертание regular) Внимание, при открытии программы настроек визуально может быть выбран шрифт Ubuntu Bold Italic - необходимо выбрать его из комбобокса повторно, иначе фокус не получится.
4. сохраняем конфигурацию
5. перезапускаем Skype

Получаем такой результат:

Теперь латиница и кириллица выглядят одинаково, что и требовалось сделать.

P.s. если схожая проблема со шрифтами (а так же с кривой темой оформления) наблюдается в wmii, xmonad, awesome или i3 даже при включенном gnome-settings-daemon, то необходимо зайти в настройки Skype и в качестве стиля выбрать "GTK+" вместо "Desktop Settings"